Terselenggaranya pendidikan dan pembelajaran yang bermutu dan humanis dalam bidang kesehatan (unggul , IPTEK)
Meningkatnya pelaksanaan penelitian bidang kesehatan berbasis nilai-nilai kearifan lokal untuk pengembangan IPTEK yang aplikatif (Umat produktif)
Meningkatnya pengabdian kepada masyarakat dalam bidang kesehatan untuk menciptakan umat yang sehat, produktif, mandiri, dan berkeadilan”. (Umat sehat dst, UU kesehatan)
Meningkatnya penerapan nilai Al-Islam dan Kemuhamadiyahan untuk menghasilkan tenaga kesehatan yang beriman dan bertaqwa serta berakhlak mulia. (IMTAQ)
Berkembangnya jejaring kerjasama antara Amal Usaha Muhammadiyah dan lembaga lainnya dalam bidang kesehatan. (unggul)
Optimalisasi manajemen pengelolaan fakultas kesehatan menuju peningkatan mutu yang berkelanjutan. (unggul)